Ekonomi yüksek lisans programı, temelde iktisat formasyonu almış öğrencilere yönelik olmakla birlikte, farklı disiplinlerden gelen öğrencilere de açıktır. Başvuru için öğrencilerin ALES’ten ilan metninde belirtilen puan türünde en az 55 puan almış olmaları gerekir. Programın toplam kredisi ise 120 AKTS'dir. Bir dersten başarılı olabilmek için en az 70 puan (B3) almak gerekmektedir. Ekonomi yüksek lisans programının süresi dört yarıyıl olup program en fazla altı yarıyılda tamamlanmalıdır. Ekonomi yüksek lisans programı, 120 AKTS kredisinden az olmamak koşuluyla, biri zorunlu yedisi seçmeli en az sekiz ders, bir seminer ile uzmanlık alan dersleri ve tez çalışmasından oluşur. Ekonomi yüksek lisans programı, öğrencilerin çağdaş iktisat biliminin gerektirdiği bilgileri edinmesini ve mezun olduktan sonra kendi istedikleri alanlarda çalışabilmeleri için ihtiyaç duyacakları altyapının oluşturulmasını sağlar. Program, lisans eğitimini tamamlamış kişileri spesifik alanlarda doktora eğitimine, esnek düşünce yapısına sahip, alanında yeterli bireyler olarak kamu sektörüne ve özel sektöre hazırlar.